近年来,随着高通量测序技术和质谱技术的迅猛发展,转录组与代谢组的联合分析已成为揭示疾病分子机制和探索临床治疗靶点的重要工具,为临床研究提供了全新的视角。疾病的发病机制及其进展过程极为复杂,基因突变、基因表达变化以及代谢改变等各种因素都影响着生命体的特征变化。单一组学数据难以全面解析复杂生理过程的调控机制,因此难以发表高水平的研究论文。采用多组学联合分析不仅能够相互验证,减少单一组学分析的局限性和假阳性,还能系统性地解析分子功能及其调控机制。转录组分析从基因RNA表达水平揭示调控网络,而代谢组则直接反映生物体内代谢产物的变化。转录组与代谢组的联合分析可以筛选出与疾病变化相关的潜在关键基因、代谢物和代谢通路,从而更深入地挖掘疾病的转录调控机制。
在疾病研究中,转录组与代谢组的联合分析主要包括以下步骤:首先,收集符合研究目的的样本,如疾病患者与健康对照组的组织、血清、血浆、细胞及体液等。对于无法直接获取的样本,需要构建模型材料进行研究。其次,进行转录组分析,提取样品中的RNA,通过高通量测序技术进行鉴定和定量,结合PCA、差异基因筛选及KEGG富集等生物信息学分析,寻找与病变相关的基因及代谢通路。此外,代谢组检测同样重要,提取样本中的代谢产物,通过色谱与质谱分析进行定性和定量,结合PCA、差异代谢物筛选及KEGG富集等分析,寻找与病变相关的代谢物及通路。随后,进行联合分析,主要包括共同的KEGG通路和富集功能的查找以及相关性分析,通过搭建相关性网络筛选出共同变化的基因、代谢物及其代谢通路,解析疾病的转录调控机制。最后,可结合分子实验对疾病的转录调控机制进行进一步验证。
以乳腺癌为研究对象的最新研究成果指出,三阴性乳腺癌(TNBC)是一种缺乏有效治疗靶点的恶性肿瘤。该研究中,通过对TNBC及ER+乳腺癌样本的代谢分析,发现了与不同类型乳腺癌特征相似的代谢特征,强调了代谢组与转录组联合分析在临床研究中的重要性。
在这一背景下,选用尊龙凯时的转录组与代谢组联合分析服务来探索腺癌患者的代谢和基因表达特征,成为了许多科研工作者的选择。该服务可以为研究人员提供系统化的数据分析流程,帮助他们从复杂的数据中提取有价值的信息,推动乳腺癌和其他疾病的研究进程。
综上所述,转录组与代谢组的联合分析,虽面临数据整合的挑战,但通过有效利用尊龙凯时提供的专业服务,科研人员能够更好地挖掘其中的潜在关联。这将为未来的生物医疗研究开辟更广阔的视野。