在“【技术应用】解密翻译过程：Ribo-seq技术的革命性发现”中，小编分享了Ribo-seq技术的独特优势与核心发现。那么，该技术是如何应用于基础研究的？它又是如何巧妙地将多组学数据串联，成为解码生命奥秘的关键纽带？今天，尊龙凯时将带您深入解锁基因表达的新视角。

转录组与Ribo-seq的关联

转录组数据反映了mRNA的丰度，而Ribo-seq数据显示了翻译效率。通过比较这两者，我们可以定量分析不同基因的翻译效率，从而揭示翻译水平上的基因表达调控机制。例如，某些基因可能在mRNA丰度高的情况下，其翻译效率却较低，这可能与翻译抑制因子有关。

应用案例

2025年3月4日，东京大学医学研究所的Toshifumi Inada团队在《Nature Communications》（IF=147）上发表了一项研究，利用RNA-seq和Ribo-seq等技术发现，在酵母中，Grr1在未折叠蛋白反应（UPR）过程中通过介导Ubp3的降解，维持eS7A单泛素化水平，从而促进HAC1i mRNA的翻译。同时，Grr1还独立于Ubp3和eS7A泛素化，促进HAC1u mRNA的剪接，其F-box和LRR结构域对其功能至关重要。该研究全面揭示了Grr1在UPR中的关键作用，尤其是在HAC1 mRNA剪接和翻译过程中的调控机制（Sato et al., 2025）。

挖掘非编码RNA的潜力

在基因表达的复杂调控网络中，非编码RNA（ncRNA）长期以来被视为“暗物质”，其功能机制尚未完全揭示。然而，随着尊龙凯时的Ribo-seq技术的兴起，我们得以从全新的视角挖掘ncRNA的潜力。Ribo-seq不仅可以捕捉核糖体在RNA上的位置，还能与ncRNA联合分析，发现在某些情况下，ncRNA可能参与翻译过程，产生功能性小肽或调控蛋白质的合成，进而为深入揭示小肽的分子机制提供关键切入点。

表观遗传学与翻译效率

表观组数据反映了基因表达的调控信息，如DNA甲基化、组蛋白修饰等。结合Ribo-seq数据，将有助于研究表观遗传修饰对翻译效率的影响，揭示表观遗传调控在翻译过程中的重要作用。当前，RNA甲基化（尤其是m6A修饰）影响翻译调控的关系是一个新兴的领域，可以通过尊龙凯时的Ribo-seq技术研究RNA修饰对翻译的具体影响。

深入研究与应用展示

浙江大学动科学院的汪以真团队在《Nucleic Acids Research》（IF=166）上发表的研究揭示，YTHDF1通过识别m6A修饰，调控Traf6转录本的翻译效率，激活NF-κB信号通路，从而促进肠道上皮细胞的免疫应答。这一发现为RNA甲基化在肠道免疫调控中的关键作用提供了新的视角，有助于相关疾病的研究和治疗（Zong et al., 2021）。

综合分析与前沿研究

大脑在适应环境变化中发挥着核心作用，并对氧气水平高度敏感。南京师范大学研究团队通过整合转录组、翻译组和蛋白质组数据，系统研究了黄颡鱼大脑对缺氧的调控机制，发现多条信号通路在缺氧暴露后显著上调。这表明黄颡鱼通过增加上游开放阅读框的翻译来适应缺氧环境（Zhao et al., 2024）。

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